Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PDK4Q16654 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms