Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLFQ16534 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLFQ16534 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLFQ16534 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLFQ16534 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLFQ16534 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLFQ16534 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLFQ16534 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HLFQ16534 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLFQ16534 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLFQ16534 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLFQ16534 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLFQ16534 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLFQ16534 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HLFQ16534 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLFQ16534 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLFQ16534 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLFQ16534 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLFQ16534 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLFQ16534 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLFQ16534 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLFQ16534 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLFQ16534 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLFQ16534 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLFQ16534 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLFQ16534 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLFQ16534 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLFQ16534 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLFQ16534 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLFQ16534 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLFQ16534 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLFQ16534 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HLFQ16534 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HLFQ16534 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLFQ16534 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLFQ16534 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLFQ16534 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLFQ16534 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HLFQ16534 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLFQ16534 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLFQ16534 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLFQ16534 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLFQ16534 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLFQ16534 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HLFQ16534 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLFQ16534 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HLFQ16534 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLFQ16534 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLFQ16534 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLFQ16534 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLFQ16534 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLFQ16534 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLFQ16534 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLFQ16534 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLFQ16534 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLFQ16534 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLFQ16534 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HLFQ16534 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLFQ16534 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLFQ16534 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLFQ16534 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLFQ16534 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLFQ16534 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLFQ16534 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLFQ16534 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLFQ16534 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLFQ16534 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLFQ16534 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HLFQ16534 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLFQ16534 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLFQ16534 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLFQ16534 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLFQ16534 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLFQ16534 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLFQ16534 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLFQ16534 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLFQ16534 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLFQ16534 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLFQ16534 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLFQ16534 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLFQ16534 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLFQ16534 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLFQ16534 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLFQ16534 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLFQ16534 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLFQ16534 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLFQ16534 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLFQ16534 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLFQ16534 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLFQ16534 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLFQ16534 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLFQ16534 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLFQ16534 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLFQ16534 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLFQ16534 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HLFQ16534 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLFQ16534 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HLFQ16534 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HLFQ16534 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HLFQ16534 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms