Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ATRQ13535 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRQ13535 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRQ13535 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRQ13535 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRQ13535 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRQ13535 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRQ13535 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRQ13535 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRQ13535 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRQ13535 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRQ13535 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRQ13535 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRQ13535 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRQ13535 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRQ13535 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRQ13535 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRQ13535 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRQ13535 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRQ13535 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRQ13535 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRQ13535 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRQ13535 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRQ13535 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRQ13535 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRQ13535 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ATRQ13535 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ATRQ13535 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATRQ13535 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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