Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VLDLRP98155 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms