Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
rp9P97762 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
rp9P97762 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
rp9P97762 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
rp9P97762 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
rp9P97762 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
rp9P97762 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
rp9P97762 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
rp9P97762 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
rp9P97762 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
rp9P97762 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
rp9P97762 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
rp9P97762 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
rp9P97762 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
rp9P97762 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
rp9P97762 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
rp9P97762 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
rp9P97762 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
rp9P97762 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
rp9P97762 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
rp9P97762 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
rp9P97762 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
rp9P97762 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
rp9P97762 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
rp9P97762 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
rp9P97762 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
rp9P97762 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
rp9P97762 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
rp9P97762 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
rp9P97762 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
rp9P97762 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
rp9P97762 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
rp9P97762 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
rp9P97762 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
rp9P97762 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
rp9P97762 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
rp9P97762 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
rp9P97762 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
rp9P97762 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
rp9P97762 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
rp9P97762 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
rp9P97762 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
rp9P97762 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
rp9P97762 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
rp9P97762 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
rp9P97762 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
rp9P97762 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
rp9P97762 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
rp9P97762 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
rp9P97762 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
rp9P97762 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
rp9P97762 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
rp9P97762 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
rp9P97762 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
rp9P97762 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
rp9P97762 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
rp9P97762 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
rp9P97762 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
rp9P97762 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
rp9P97762 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
rp9P97762 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
rp9P97762 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
rp9P97762 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
rp9P97762 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
rp9P97762 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
rp9P97762 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
rp9P97762 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms