Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPREP23469 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPREP23469 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPREP23469 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPREP23469 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPREP23469 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPREP23469 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPREP23469 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPREP23469 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPREP23469 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPREP23469 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPREP23469 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPREP23469 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPREP23469 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPREP23469 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPREP23469 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPREP23469 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPREP23469 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPREP23469 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPREP23469 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPREP23469 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPREP23469 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPREP23469 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPREP23469 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPREP23469 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPREP23469 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPREP23469 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPREP23469 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPREP23469 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPREP23469 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPREP23469 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPREP23469 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPREP23469 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPREP23469 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPREP23469 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPREP23469 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPREP23469 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPREP23469 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPREP23469 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPREP23469 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPREP23469 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPREP23469 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPREP23469 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms