Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms