Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms