Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sema3aO08665 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sema3aO08665 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sema3aO08665 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sema3aO08665 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Sema3aO08665 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sema3aO08665 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Sema3aO08665 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sema3aO08665 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3aO08665 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3aO08665 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3aO08665 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3aO08665 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3aO08665 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3aO08665 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3aO08665 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3aO08665 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3aO08665 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3aO08665 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3aO08665 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3aO08665 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3aO08665 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3aO08665 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3aO08665 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3aO08665 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema3aO08665 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3aO08665 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3aO08665 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3aO08665 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3aO08665 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3aO08665 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3aO08665 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3aO08665 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3aO08665 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3aO08665 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3aO08665 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3aO08665 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema3aO08665 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms