Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AGRNO00468 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AGRNO00468 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AGRNO00468 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AGRNO00468 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AGRNO00468 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AGRNO00468 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AGRNO00468 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AGRNO00468 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AGRNO00468 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AGRNO00468 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AGRNO00468 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AGRNO00468 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AGRNO00468 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AGRNO00468 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AGRNO00468 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AGRNO00468 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AGRNO00468 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AGRNO00468 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms