Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

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Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm3443F7CCV5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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