Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop56Q9D6Z1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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