Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM8Q9BZR9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms