Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSD3Q9BZ95 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms