Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pagr1aQ99L02 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms