Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms