Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZC2HC1AQ96GY0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZC2HC1AQ96GY0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZC2HC1AQ96GY0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZC2HC1AQ96GY0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZC2HC1AQ96GY0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZC2HC1AQ96GY0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZC2HC1AQ96GY0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZC2HC1AQ96GY0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZC2HC1AQ96GY0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZC2HC1AQ96GY0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZC2HC1AQ96GY0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZC2HC1AQ96GY0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZC2HC1AQ96GY0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZC2HC1AQ96GY0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZC2HC1AQ96GY0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZC2HC1AQ96GY0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZC2HC1AQ96GY0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZC2HC1AQ96GY0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZC2HC1AQ96GY0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZC2HC1AQ96GY0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZC2HC1AQ96GY0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZC2HC1AQ96GY0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZC2HC1AQ96GY0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms