Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSR2Q969E8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms