Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP188Q5SRE5 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms