Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn13Q3UW68 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms