Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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PCM1Q15154 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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PCM1Q15154 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
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PCM1Q15154 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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PCM1Q15154 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PCM1Q15154 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
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PCM1Q15154 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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PCM1Q15154 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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PCM1Q15154 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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PCM1Q15154 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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PCM1Q15154 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCM1Q15154 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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