Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ERCC6Q03468 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
ERCC6Q03468 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms