Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EXOSC10Q01780 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms