Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBP2P50120 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP2P50120 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP2P50120 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP2P50120 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP2P50120 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP2P50120 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP2P50120 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP2P50120 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP2P50120 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP2P50120 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP2P50120 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP2P50120 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP2P50120 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP2P50120 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP2P50120 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP2P50120 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP2P50120 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP2P50120 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP2P50120 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP2P50120 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP2P50120 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP2P50120 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP2P50120 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP2P50120 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP2P50120 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP2P50120 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP2P50120 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP2P50120 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP2P50120 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RBP2P50120 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBP2P50120 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBP2P50120 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBP2P50120 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBP2P50120 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBP2P50120 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBP2P50120 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RBP2P50120 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBP2P50120 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBP2P50120 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBP2P50120 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBP2P50120 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBP2P50120 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBP2P50120 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBP2P50120 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBP2P50120 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBP2P50120 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBP2P50120 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBP2P50120 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBP2P50120 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBP2P50120 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBP2P50120 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBP2P50120 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBP2P50120 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBP2P50120 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBP2P50120 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBP2P50120 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RBP2P50120 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RBP2P50120 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RBP2P50120 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms