Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cav1P49817 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cav1P49817 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cav1P49817 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cav1P49817 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms