Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RANGAP1P46060 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms