Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms