Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LRATO95237 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRATO95237 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRATO95237 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRATO95237 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRATO95237 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRATO95237 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRATO95237 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRATO95237 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRATO95237 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRATO95237 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRATO95237 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRATO95237 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRATO95237 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRATO95237 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRATO95237 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRATO95237 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRATO95237 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRATO95237 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRATO95237 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRATO95237 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRATO95237 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRATO95237 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRATO95237 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRATO95237 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRATO95237 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRATO95237 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRATO95237 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRATO95237 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRATO95237 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRATO95237 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRATO95237 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRATO95237 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRATO95237 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRATO95237 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRATO95237 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LRATO95237 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LRATO95237 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LRATO95237 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LRATO95237 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LRATO95237 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRATO95237 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRATO95237 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms