Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG12O94817 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG12O94817 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG12O94817 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms