Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Slc18a3O35304 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Slc18a3O35304 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Slc18a3O35304 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Slc18a3O35304 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Slc18a3O35304 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc18a3O35304 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc18a3O35304 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc18a3O35304 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc18a3O35304 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc18a3O35304 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc18a3O35304 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc18a3O35304 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc18a3O35304 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Slc18a3O35304 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms