Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBE1Q9UJT0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms