Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HCN3Q9P1Z3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HCN3Q9P1Z3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms