Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RLIMQ9NVW2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RLIMQ9NVW2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.1 ms