Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAT1Q99536 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms