Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHIPQ96QV1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms