Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PAXIP1Q6ZW49 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PAXIP1Q6ZW49 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms