Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NANOGP8Q6NSW7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms