Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms