Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE3BQ13370 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
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