Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms