Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EMX2Q04743 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms