Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVFC1P60507 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms