Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NESP48681 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NESP48681 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NESP48681 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NESP48681 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NESP48681 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NESP48681 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NESP48681 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NESP48681 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.49
NESP48681 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NESP48681 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NESP48681 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NESP48681 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
NESP48681 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NESP48681 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NESP48681 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NESP48681 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
NESP48681 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
NESP48681 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NESP48681 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NESP48681 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NESP48681 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NESP48681 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NESP48681 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NESP48681 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NESP48681 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NESP48681 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NESP48681 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NESP48681 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NESP48681 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NESP48681 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NESP48681 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NESP48681 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NESP48681 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NESP48681 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NESP48681 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NESP48681 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NESP48681 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NESP48681 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NESP48681 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NESP48681 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NESP48681 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NESP48681 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NESP48681 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
NESP48681 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NESP48681 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NESP48681 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NESP48681 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NESP48681 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NESP48681 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NESP48681 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NESP48681 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NESP48681 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NESP48681 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NESP48681 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NESP48681 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NESP48681 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NESP48681 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NESP48681 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NESP48681 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NESP48681 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NESP48681 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
NESP48681 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NESP48681 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
NESP48681 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NESP48681 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NESP48681 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
NESP48681 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
NESP48681 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NESP48681 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NESP48681 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NESP48681 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NESP48681 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NESP48681 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NESP48681 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NESP48681 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NESP48681 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NESP48681 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NESP48681 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NESP48681 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NESP48681 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NESP48681 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NESP48681 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NESP48681 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NESP48681 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NESP48681 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NESP48681 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NESP48681 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NESP48681 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NESP48681 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NESP48681 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NESP48681 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NESP48681 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NESP48681 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NESP48681 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
NESP48681 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NESP48681 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NESP48681 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NESP48681 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NESP48681 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms