Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RdxP26043 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RdxP26043 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RdxP26043 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RdxP26043 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RdxP26043 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RdxP26043 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RdxP26043 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RdxP26043 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RdxP26043 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RdxP26043 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RdxP26043 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RdxP26043 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RdxP26043 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RdxP26043 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RdxP26043 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RdxP26043 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RdxP26043 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RdxP26043 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RdxP26043 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RdxP26043 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RdxP26043 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RdxP26043 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RdxP26043 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RdxP26043 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RdxP26043 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RdxP26043 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RdxP26043 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RdxP26043 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RdxP26043 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RdxP26043 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RdxP26043 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RdxP26043 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RdxP26043 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RdxP26043 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RdxP26043 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RdxP26043 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RdxP26043 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RdxP26043 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RdxP26043 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RdxP26043 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RdxP26043 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RdxP26043 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RdxP26043 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RdxP26043 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RdxP26043 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RdxP26043 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RdxP26043 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RdxP26043 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RdxP26043 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RdxP26043 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RdxP26043 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RdxP26043 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RdxP26043 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RdxP26043 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RdxP26043 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RdxP26043 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RdxP26043 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RdxP26043 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RdxP26043 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RdxP26043 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RdxP26043 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RdxP26043 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RdxP26043 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms