Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCL3P20749 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCL3P20749 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCL3P20749 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCL3P20749 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCL3P20749 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCL3P20749 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCL3P20749 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCL3P20749 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCL3P20749 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCL3P20749 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCL3P20749 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCL3P20749 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCL3P20749 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCL3P20749 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCL3P20749 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCL3P20749 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCL3P20749 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BCL3P20749 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BCL3P20749 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms