Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CYTIPO60759 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CYTIPO60759 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CYTIPO60759 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CYTIPO60759 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CYTIPO60759 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CYTIPO60759 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CYTIPO60759 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CYTIPO60759 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CYTIPO60759 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CYTIPO60759 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CYTIPO60759 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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