Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc170D3YXL0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc170D3YXL0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms