Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX15Q9NRS6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms