Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms