Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC136Q96JN2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC136Q96JN2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms